- 26 décembre 2004: séisme au large de Sumatra générant un tsunami, 220.000 morts autour de l'Océan indien, dont 168.000 en Indonésie.
- 28 mars 2005: séisme dans l'île de Nias près de Sumatra, 900 morts.
- Avril-juillet 2006: éruption du volcan Merapi, des dizaines de milliers de villageois évacués.
- 27 mai 2006: séisme dans la région de Yogyakarta, 6.000 morts et 1,5 million de sinistrés.
- 29 mai 2006 jusqu'à maintenant: éruption de boue volcanique à Java, une quinzaine de morts, plus de 15.000 sinistrés.
- 17 juillet 2006: tsunami sur la côte de Java, 650 morts, plus de 100.000 sinistrés.
- 24-29 décembre 2006: glissements de terrain et inondations à Sumatra, plus de 100 morts, 200 disparus et 350.000 sinistrés.
- 1er janvier 2007: un Boeing 737 de la compagnie Adam Air s'abîme en mer, 102 morts.
- 1er-5 février 2007: Inondations à Jakarta, environ 80 morts, 500.000 sinistrés et un milliard de dollars de coût.
- 22 février 2007: un ferry prend feu au large de Jakarta, 53 morts, des dizaines de disparus.
- 6 mars 2007: séisme à Sumatra: 70 morts, selon un bilan provisoire.
- 7 mars 2007: crash d'un Boeing 737 de la Garuda à Yogykarta, sur l'île de Java.