Oui, et plutôt facilement.
Si ce n'est déjà fait, tu commences par ajouter les fichiers AIFF que tu veux convertir à ta bibliothèque iTunes (menu "Ajouter à la bibliothèque" dans iTunes). Puis tu sélectionnes, dans les préférences, onglet importation, l'encodeur que tu veux utiliser pour ta conversion, ainsi que le débit voulu.
Ensuite tu sélectionnes dans ta bibliothèque les morceaux que tu veux encoder, puis tu les convertis (menu Avancé > Convertir la sélection en ...). Et voila !