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Je ne sais pas ce qu'il fait exactement, mais si ça peut te rassurer le processus tourne aussi chez moi, avec Lion installé depuis 1h sur une partition vierge, donc c'est pas une saloperie.
[Edit]
Dans les préférences de Safari, j'ai remarqué que l'onglet Confidentialité listait le nombre de cookies et les sites associés, je n'ai pas souvenir de ça sous Snow Leo (ma mémoire peut me faire défaut cela dit, surtout à cette heure-ci), donc c'est probablement lié à ça.