Bonjour Roy,
Après un petit essai, iMovie 5.0.2 (111), j'ai eu le même problème en important une vidéo venant d'un APN au format .MOV dans un projet 16/9. Problème contourné par une importation de la même vidéo au format .DV dans iMovie.
MpegStreamclip te permet d'agrandir, de changer les proportions et de recadrer une vidéo. Il y a encore d'autres options possibles qu'il serait trop long d'énumerer ici.